Asam Amino

      Asam amino merupakan unit penyusun protein 

          Struktur: satu atom C sentral yang mengikat secara kovalent:

                -  gugus amino,

        - gugus karboksil,

        - satu atom H dan

                - rantai samping (gugus R)   

Asam amino standar

Asam amino yang menyusun protein organisme ada 20 macam disebut sebagai asam amino standar.

Klasifikasi Asam amino:

Asam amino diklasifikasikan berdasar gugus R (rantai samping)

1. Asam amino non polar

- Memiliki gugus R alifatik

- Glisin, alanin, valin, leusin, isoleusin dan prolin

Glisin                                                     Alanin

 

Valin                                                                Leusin

 

 

 Isoleusin                                                        Prolin

  

- Bersifat hidrofobik. Semakin hidrofobik suatu a.a spt Ile (I) à biasa terdapat di bagian dlm protein.

- Prolin berbeda dgn a.a à siklis. Tapi mempunyai byk kesamaan sifat dgn kelompok alifatis ini.

- Umum terdapat pada protein yang berinteraksi dengan lipid

2. Asam amino polar

- Memiliki gugus R yang tidak bermuatan

- Serin , threonin, sistein, metionin, asparagin, glutamin

Serin                                                                                                Thereonin

  

Sistein                                                       Metionin

 

Asparagin                                                        Glutamin

 

- Bersifat hidrofilik à mudah larut dalam air

- Cenderung terdapat di bagian luar protein

- Sistein berbeda dgn yg lain, karena gugus R terionisasi pada pH tinggi (pH = 8.3) sehingga dapat mengalami oksidasi dengan sistein membentuk ikatan disulfide

  n (-S-S-) à sistin (tdk tmsk dlm a.a. standar karena selalu tjd dari 2 buah molekul sistein dan tidak dikode oleh DNA)

3. Asam amino dengan gugus R aromatik

- Fenilalanin, tirosin dan triptofan

Fenilalanin                                                                Tirosin

 

- Bersifat relatif non polar à hidrofobik

- Fenilalanin bersama dgn V, L & I à a.a plg hidrofobik

- Tirosin à gugus hidroksil , triptofan à cincin indol

- Sehingga mampu membentuk ikatan hidrogen à penting untuk menentukan struktur ensim

- Asam amino aromatik mampu menyerap sinar UV λ 280 nm à sering digunakan utk menentukan kadar protein

4. Asam amino dengan gugus R bermuatan positif

- Lisin, arginin, dan histidin

Lisin                                                            Arginin

 

Histidin

 

- Mempunyai gugus yg bersifat basa pd rantai sampingnya

- Bersifat polar à terletak di permukaan protein dapat mengikat air.

- Histidin mempunyai muatan mendekati netral (pd gugus imidazol) dibanding

    0) lisin à gugus amino

      0) arginin à gugus guanidino

- Krn histidin dapat terionisasi pada pH mendekati pH fisioligis à sering berperan dalam reaksi ensimatis yg melibatkan pertukaran proton

5. Asam amino dengan gugus R bermuatan negatif

-Aspartat dan glutamat

Aspartat                                                               Glutamat
 

- Mempunyai gugus karboksil pada rantai sampingnya à bermuatan (-)/acid pada pH 7

Asam amino non standar

- Merupakan asam amino diluar 20 mcm as. Amino standar

- Terjadi karena modifikasi yang terjadi setelah suatu asam amino standar menjadi protein.

- Kurang lebih 300 asam amino non standar dijumpai pada sel

--> modifikasi serin yang mengalami fosforilasi oleh protein kinase